摘要:随南方草食畜牧业发展,苜蓿种植面积不断扩大,筛选高效固氮竞争结瘤能力强的苜蓿根瘤菌,能够促进安徽苜蓿产量的提升。本研究从安徽不同生态区分离苜蓿根瘤菌,对菌株的16S rRNA和持家基因(atpD和glnⅡ)进行测序分析。结果表明:从安徽不同地区苜蓿根瘤中分离到根瘤菌菌株21株(19个中华苜蓿根瘤菌Sinorhizobium meliloti)。16S rRNA、atpD和glnⅡ核酸序列的多态性位点分别有67、49和125个,glnⅡ的多态性指标最高,平均核苷酸差异也最大,中性检验Fu and Li’s D表明16S rRNA符合中性漂变,2个持家基因都受到一定的环境选择压影响。3个基因分析菌株自然居群的聚类的遗传距离并不完全一致,16S rRNA聚类遗传距离最小,glnⅡ聚类遗传距离最大。3个基因对21菌株聚类结果基本一致,但也有一些差异,并且来自皖南沿江及山地生态区的根瘤菌遗传多样性丰富,被聚到不同的遗传亚群中。所有的菌株3个基因的序列和NCBI上已知菌株都存在差异,说明这些菌株都是新菌株。