摘要:【目的】探究紫花苜蓿组4个野生栽培品种和1个野生资源叶绿体基因组结构的异同和亲缘关系,解释紫花苜蓿组植物叶绿体基因组的多样性。【方法】通过Illumina第二代高通量测序技术进行叶绿体基因组测序、拼接和注释以及比较分析,并与来源于NCBI上的12个紫花苜蓿苜蓿组植物进行系统发育分析。【结果】5个植物全部属于IRLC(Inverted repeat-lacking clade)类群,即只含有一个IR区,基因组总长度介于121,383bp蓝花苜蓿～127,679bp‘保定’紫花苜蓿之间,共编码108～110个基因,总GC含量为:33.8%‘保定’紫花苜蓿～33.9%‘德钦’紫花苜蓿,均缺少rps16、rpl22和infA基因,其中蓝花苜蓿还缺少clpP和trnI-CAU基因；确定了重复序列和筛选出6个高变区；系统发育分析表明:黄花苜蓿和‘呼伦贝尔’黄花苜蓿互为姐妹关系,‘德钦’紫花苜蓿、‘清水’紫花苜蓿、‘保定’紫花苜蓿和蓝花苜蓿与紫花苜蓿聚为一个单系枝,表明他们的亲缘关系较近,遗传背景具有趋同性。【结论】本研究结果有助于增加对紫花苜蓿组系统发生关系的理解,并为后续开展紫花苜蓿组及苜蓿属种质资源鉴定、遗传育种以及遗传多样性保护等研究提供分子信息。
